Marin kartlegging
For å sikre bærekraftig bruk av skjærgården er kommunen avhengig av å ha oppdatert kunnskap om naturverdiene som finnes. Skjærgården er under kontinuerlig press, både med tanke på båtbruk, etablering av brygger og annen infrastruktur og mudring. I en rapport fra 2021 laget på bestilling av Fredrikstad kommune, kartlegger og beskriver COWI naturmangfoldet og tilstanden til havbunnen langs deler av Onsøykysten. Kommunen vil bruke rapporten aktivt i forvaltningen av skjærgården, og den vil være spesielt nyttig som et oppdatert kunnskapsgrunnlag ved behandling av søknader om tiltak i sjøen. Om alt går etter planen, vil kartleggingen av Onsøykysten fortsette i 2022.
Av tareskog ble det i hovedsakelig observert sukkertare, i tillegg til stortare og fingertare. De viktigste og største tareskogforekomstene finnes langs den sørvestlige delen av Rauer. Totalt ble 15 ålegressenger registrert, hvorav de største forekomstene var i rundt nordre deler av Rauer. Av fremmedarter ble japansk drivtang påtruffet ved Skjæløy og stillehavsøsters ved Risholmen. Naturtypene relatert til eksponert blåskjellbunn og ruglbunn ble ikke påtruffet under kartleggingen.